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Evolutionary origin and geographic distribution of mammalian coronaviruses.
vendredi 20 janvier 2023

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Descriptif

The Coronaviridae is a family of 54 recognized coronaviruses, seven of which infect humans, with three, including the SARS-CoV2, causing diseases. While coronaviruses are especially prone to cause other diseases, we know little about their evolutionary history, host-to-host transmissions, and biogeography, turning difficult the prediction of future transmission scenarios. One of the difficulties lies in dating the origination of the family, a particularly challenging task. Instead, we use a probabilistic cophylogenetic model that reconciliates mammals and coronaviruses phylogenies using events of cospeciations, host switches, duplications, and losses. Our results support a scenario of recent origination of coronaviruses in bats and diversification by host-switches, with preferential host-switches within mammalian orders, and rare transmissions from bats to other mammalian lineages. Hotspots of diversity are concentrated in East-Asia and Europe, a reflection of relatively recent and localised host-switches.

Conférence de Hélène Morlon, directrice de recherche en biologie évolutive à l'Institut de biologie (IBENS) au département de biologie de l'ENS-PSL, dans le cadre de l’édition 2023 de la Conférence Olivier Legrain Sciences et Société intitulée "Louis Pasteur à l’ENS : rencontre entre chimie et biologie"

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Auteur(s)
Hélène Morlon
Ecole normale supérieure
Biologiste

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Institutions : Ecole normale supérieure-PSL

Cursus :

Mathématicienne de formation, Hélène Morlon est responsable d'une équipe de recherche (Modélisation de la Biodiversité) à l'Institut de Biologie de l'ENS Paris.
Mathématicienne de formation, Hélène Morlon est titulaire d’un DEA écologie-évolution. Après une thèse principalement expérimentale en écotoxicologie soutenue en 2005, elle part en post-doctorat aux Etats-Unis et commence à y développer les thématiques de recherche qui l’animent encore aujourd’hui : la modélisation de la biodiversité. Elle développe des modèles novateurs qui, appliqués à de larges jeux de données empiriques (en particulier les arbres phylogénétiques des espèces actuelles), permettent de comprendre les différents facteurs écologiques et évolutifs qui façonnent l’évolution à long terme (sur des millions d’années) de la biodiversité. Elle s’intéresse en particulier aux facteurs influençant la diversification des espèces (spéciation et extinction) et leur évolution phénotypique.
En 2010, elle intègre le CNRS, au Centre de Mathématiques Appliquées de l’Ecole Polytechnique, et forme une équipe de jeunes chercheurs grâce à l’obtention d’une bourse « ANR Chaire d’Excellence ». Son équipe y développe notamment des modèles permettant de tester comment les variations environnementales du passé ont affecté la diversification (spéciation et extinction) des espèces et démontre comment des différences de diversification des espèces en zone tropicale et tempérée contribuent à la forte richesse en espèces des régions tropicales. En 2014, elle obtient un financement ERC « consolidator » et se classe première au concours de création « Jeunes Equipes » de l’Institut de Biologie de l’ENS (IBENS), ce qui lui permet d’y développer son équipe autour du projet ERC. Elle est également lauréate de la médaille de bronze du CNRS en 2015.
Parallèlement à ses activités de recherche, Hélène Morlon a une activité d’expertise soutenue : elle est éditeur dans trois journaux à fort facteur d’impact (PloS Biology, Ecology Letters, et Systematic Biology), et reviewer pour les grands journaux ainsi que pour l’ERC et l’ANR. Elle est également impliquée dans le développement d’un outil de visualisation en ligne de l’arbre du vivant (http://www.onezoom.org/). Hélène Morlon s’efforce également d’encourager et valoriser les femmes dans la science, notamment en accueillant dans son groupe de recherche des jeunes femmes et en les préparant au mieux au métier de chercheur. Depuis 2010, elle a ainsi accueilli 3 étudiantes en master, 5 étudiantes en thèse et une chercheuse en post-doctorat.
Sa spécialité : l’évolution de la biodiversité, qu’elle étudie en conciliant modèles probabilistes et phylogénie moléculaire.
Prix Irène Joliot-Curie 2017 dans la catégorie "Jeune Femme scientifique", décerné pour ses travaux sur la modélisation de la biodiversité.

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Dernière mise à jour : 10/03/2023